A endometriose não tem cura mas pode ser controlada. Entre os vários tratamentos se incluem o cuidado com a dieta até a suspensão da menstruação. O uso de analgésicos como paracetamol ou ibuprofen é indicado para quem tem sintomas leves e não precisa preocupar-se com a infertilidade. Para quem tem sintomas graves e planeja ter filhos a alternativa é a cirurgia conservadora de cauterização dos tecidos inflamados por meio de laparoscopia. Mulheres que não desejam ou não querem mais filhos podem controlar a endometriose com o uso de anticoncepcional oral ou injetável de progestogênio. Esta terapia interrompe a menstruação, levando o endométrio a atrofia por longo período, de meses até vários anos após sua interrupção. O tratamento com o hormônio GnRH, que imita o que o organismo produz naturalmente é uma alternativa para os casos de endometriose grave. A substância leva o organismo a entrar em uma espécie de menopausa controlada.

Paralelamene aos tratamentos medicamentosos é fundamental manter uma dieta balanceada para corrigir deficiências de certos nutrientes e atenuar os sintomas da endometriose. As vitaminas, minerais e ácidos graxos essenciais obtidas por meio de uma alimentação adequada e de suplementos, quando for o caso, podem ajudar na recuperação da fertilidade e no alívio do processo inflamatório além de reduzir muito o sofrimento de quem convive com dor crônica, pois tais nutrients melhoram substancialmente a resistência à dor.