Realizado depois de dois anos de pesquisas e três de preparação, No Coração dos Deuses nasceu de um antigo sonho do diretor Geraldo Moraes, que desde a adolescência queria filmar a saga dos bandeirantes. O filme traz para os dias de hoje a história dos desbravadores, que partiram de São Paulo e se dirigiram para o grande sertão.

     Por um capricho do destino, um fragmento do roteiro de Martírios, local descoberto pelos bandeirantes e onde supostamente há muito ouro, chega às mãos de um garoto em um vilarejo dos dias atuais. Um bizarro grupo de aventureiros decide seguir a trilha das Bandeiras: um antiquário, um falsário, um homem que vive de bicos, um garoto e seu tio, que é professor na escola local. Os modernos bandeirantes são perseguidos por uma tribo de índios, sendo socorridos por uma velha senhora. Ela entrega a eles roupas e armas seculares, o que os levará de volta para o século 17. Juntos, enfrentarão a Bandeira de Fernão Dias e Borba Gato, os temidos índios Araés e a perseguição dos soldados invasores.