Espanha, 1944, fim da Guerra Civil: recém-casada, Carmen muda-se com sua filha Ofélia para a casa de seu novo marido, o autoritário Vidal, capitão do exército de Franco. Assustada, a menina refugia-se num misterioso labirinto e conhece Pan, uma criatura mágica. Ele lhe revela que Ofélia precisa cumprir três perigosas provas para voltar a ser uma princesa. O filme divide-se entre o fantástico (o universo infantil) e o terror (a guerra).